يقوم قسم الشؤون المالية بمتابعة احتياجات الجامعة المالية والعمل على انجاز الاعمال من خلال نشاط كل شعبة من شعب القسم التابعة للقسم المالي وكلا حسب اختصاصه تعتبرشعب القسم المالي وحدة واحدة متكاملة مع بعضها ضمن عائلة قسم الشؤون المالية وكما يلي :
1.شعبة الحسابات : تعتبر شعبة الحسابات ضمن تشكيلات التي يتم تمويلها اسوة بالكليات والمعاهد التابعة للجامعة وهي تقوم بتنفيذ الموازنة التي تتعلق بالمستلزمات الخدمية والسلعية وصيانة الموجودات بعد استحصال الموافقات الاصولية من خلال صرف الرواتب والمخصصات وتمشية كافة المعاملات الخاصه بمركز الجامعة .
2.شعبة التجهيزات : تلبية احتياجات اقسام الجامعة من المواد المشتراة من قبل اللجان المركزية للموجودات الثابتة والاجهزة والمعدات والقرطاسية والاستهلاكية والرياضية والادوات الاحتياطية للسيارات واستلام الهدايا والهبات من قبل الوزارة وتوزيعها على الكليات والمراكز والمعاهد وحسب توجيهات رئيس الجامعة وجرد الموجودات الخاصة باقسام الجامعة وتشكيل لجان الشطب لغرض شطب المواد المستهلكه بعد استحصال الموافقات الاصولية ومتابعة المخازن وتنظيمها بكل ما يتعلق بأدخل المواد واخراجها ضمن سجلات شعبة التجهيزات .